FAQ - System Tray - Что такое иконка на System Tray ?

Ответ на этот вопрос объясняет некорректность вопроса 2. Иконка на Tray'е это просто картинка, а не окно какой-либо программы (исследование системы с помощью Microsoft Spy++ for Windows 95 показывает, что это не окно вообще). System Tray отслеживает события мыши над иконкой и, в случае надобности, показывает ToolTip для этой иконки. Так же он отсылает сообщения о всех действиях мыши над иконкой окну, которое поместило иконку на Tray.

Таким образом, нельзя поместить программу на Tray. Любая программа может добавить стоько иконок на Tray, сколько ей необходимо. При этом главное окно программы не обязано исчезать или минимизироватся - примером может служить Microsoft Internet Mail, помещающая иконку "конверт" на Tray в случае появления новых писем.