FAQ - System Tray - Многие программы минимизируясь, оказываются на Tray, как это сделать ?

Hа самом деле, не "программа оказывается на Tray", а только иконка помещается на Tray, а главное окно программы скрывается. Для достижения такого результата вам надо обрабатывать сообщение WM_SIZE, и при значении wParam, равном SIZE_MINIMIZED вы должны выполнить примерно следующую последовательность действий: добавить иконку на Tray и скрыть окно - вызвать ShowIndow(hWnd, SW_HIDE).

Когда произойдет действие, которое должго активировать вашу программу - WM_LBUTTONDBLCLK или WM_LBUTTONDOWN (или то, что нравится вам), вы должны удалить иконку и вызвать ShowWindow(hWnd,SW_SHOW) или ShowWindow(hWnd,SW_SHOWMAXIMIZED).